国家天文台2001年4月25日在京成立， 国家天文台由分布于全国的八大天文台、站与高等院校合建的四个天文和天体物理中心整合而成，主要任务是：统筹我国天文学科发展布局、大中型观测设备运行和承担国家级大科学工程建设项目；负责科研工作的宏观协调和指导；优化资源和人才配置；与高等院校结合形成若干研究中心，充分发挥天文观测、研究和学科交叉融合的优势。
　　“基础研究必须要有世界眼光和科学战略思维，不能满足于在国内称老大，一定要到国际上争光，到国际前沿去拼搏，做出世界一流成果。”成立仪式上，中科院院长路甬祥对国家天文台寄予厚望。
　　北京天文台融入国家天文台，云南天文台、乌鲁木齐天文站、长春人造卫星观测站并入天文台，南京天文仪器中心转制为科技型企业。紫金山天文台、上海天文台继续保留法人资格，学术上受国家天文台的宏观协调和指导。